Во исполнение полномочий на проведение ведомственного контроля качества и безопасности медицинской деятельности (Положение о Министерстве здравоохранения Калининградской области, утвержденное постановлением Правительства Калининградской области от 11 мая 2010 года № 311, ст.89  Федерального закона от 21.11.2011 года № 323-ФЗ «Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации») Министерством здравоохранения Калининградской области осуществляется ведомственный контроль качества и безопасности медицинской деятельности подведомственных медицинских организаций при оказании медицинской помощи гражданам, проживающим в Калининградской области. Порядок проведения ведомственного контроля регламентирован приказом Минздрава России от 21.12.2012 № 1340, приказом министра здравоохранения Калининградской области от 29 декабря 2018 года № 791 «Об организации проведения ведомственного контроля качества и безопасности медицинской деятельности» и проводится в виде плановых и внеплановых, документарных и выездных проверок.

При проведении проверок контролируется применение медицинскими организациями порядков оказания медицинской помощи и стандартов медицинской помощи; соблюдение безопасных условий труда, требований по безопасному применению и эксплуатации медицинских изделий и их утилизации (уничтожению); соблюдение медицинскими работниками, руководителями медицинских организаций, ограничений, применяемых к ним при осуществлении профессиональной деятельности в соответствии с настоящим Федеральным законом от 21.11.2011 года № 323-ФЗ «Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации»).

План проверочных мероприятий ежегодно утверждается министром здравоохранения Калининградской области. Внеплановые проверки инициируются по обращениям граждан, поручениям Росздравнадзора, прокуратуры КО или СК России по Калининградской области. Сроки проведения проверок не превышают двадцать рабочих дней (бывают исключения).

Результаты проверок оформляются в виде акта проверки, форма которого утверждена приказом министра. При выявлении нарушений законодательства в сфере здравоохранения оформляется предписание об устранении выявленных при проверке нарушений с перечислением выявленных нарушений и мероприятий по устранению выявленных нарушений, указывается срок исполнения предписания.